1. 개요
펍켐(PubChem)은 NIH(National Institutes of Health)의 세계 최대 개방형 화학 및 생화학 데이터베이스(open chemistry database)를 보유한 미국 정부기관인 국립의학도서관(NLM,The National Library of Medicine)소속이자 또한 여기서 운영하는 웹사이트로 인류에 대한 건강정보의 자유로운 접근을 목표로 한다.[1][2] 여기서 개방(open)은 과학 데이터를 펍켐(PubChem)에 저장할 수 있고 다른 사람이 사용할 수 있음을 의미한다. 2004년 서비스 개시 이후 펍켐(PubChem)은 과학자, 학생 및 일반 대중을 위한 핵심 화학 정보 리소스가 되었다. 매달 해당 웹사이트와 프로그래밍 방식 서비스는 전 세계 수백만 사용자에게 데이터를 업데이트된 정보로 제공한다. 이러한 서비스의 방향은 펍켐(PubChem)이 정보의 독점을 거부하고 정보의 공유가 가져다주는 인류의 미래가치를 보다 가시화하고 있음을 보여준다고 할수있다. [3]2. 익스플로러 케미스트리
익스플로러 케미스트리 또는 화학(물질) 탐색(Explore Chemistry)은 펍켐(PubChem)에서 제공하는 방대한 연관 검색 엔진으로 이는 신뢰할 수 있는 출처에서 화학 정보를 빠르게 찾을 수 있도록 알고리즘화된 정교한 프로그래밍 방식 서비스(programmatic services)이다.3. 화학물질 DB
펍켐(PubChem)은 대부분 작은 분자 또는 저분자를 포함하지만 뉴클레오티드, 탄수화물, 지질, 펩티드 및 화학적으로 변형된 거대 분자 또는 고분자와 같은 더 큰 분자도 포함하고 있는 방대한 데이터베이스(DB,database)들에 보다 신속 정확하게 접근할수있도록 하는 엔진을 제공하고 있다. 펍켐(PubChem)은 화학 구조, 식별자, 화학적 및 물리적 특성, 생물학적 활성, 특허, 건강, 안전, 독성 데이터 및 기타 여러 정보에 대한 정보를 수집하고 정리한다.한편 펍켐에서 제공하는 기본 파일포멧으로는 .sdf, JSON, XML등을 2D와 3D 구조에서 제공하고있다.
4. 라이선스
펍켐(PubChem)은 기본적으로 무제한의 정보 접근 및 재사용을 허락하지만 일부 정보제공자의 있을수있는 독점적 또는 저작권 문제의 소지에 대한 고지를 통해 이러한 문제의 사전방지를 사용자의 몫으로 안내하고있다. [4] 펍켐은 NIH(National Institutes of Health)산하의 NLM(National Library of Medicine)에서 NCBI(National Center for Biotechnology Information)기관을 통해 운영을 지원하고 있다.[5][6]5. 켐스파이더
PubChem과 유사한 대규모 DB사이트로는 켐스파이더(chemspider.com)가 있다. 켐스파이더는 Royal Society of Chemistry에서 제공하는 화학 데이터베이스로, 화학 구조와 관련된 정보를 검색하고 탐색할 수 있는 강력한 도구이다. 주로 연구자, 학생, 그리고 화학 관련 직종 종사자들이 화학 물질에 대한 정보를 얻는 데 사용된다.[7] 한편 켐스파이더는 PubChem, ChEMBL, ZINC 등 다양한 화학 데이터베이스와 통합을 지향한다는 점에서 그 방향성이 매우 긍정적으로 주목 받고 있다.6. 관련항목
[1]
Accessibility on the NLM Website
https://www.nlm.nih.gov/accessibility.html
[2]
PubChem Docs,About PubChem - https://pubchemdocs.ncbi.nlm.nih.gov/about
[3]
펍켐 공식 웹사이트
https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/
[4]
National Library of Medicine https://www.nlm.nih.gov/copyright.html
[5]
NLM Web Policies https://www.nlm.nih.gov/web_policies.html
[6]
NLM Web Policies- Copyright https://www.nlm.nih.gov/web_policies.html#copyright
[7]
켐스파이더 공식사이트
https://www.chemspider.com